Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRB1P82279 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRB1P82279 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRB1P82279 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRB1P82279 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms