Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM193AP78312 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms