Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LMO4P61968 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LMO4P61968 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LMO4P61968 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LMO4P61968 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LMO4P61968 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LMO4P61968 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LMO4P61968 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LMO4P61968 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LMO4P61968 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LMO4P61968 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LMO4P61968 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LMO4P61968 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LMO4P61968 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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