Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABARAPL2P60520 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms