Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP12AP54707 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms