Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA2D1P54289 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms