Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMSP52788 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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