Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA2P51531 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms