Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB28P51157 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms