Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSEN1P49768 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms