Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NESP48681 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NESP48681 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NESP48681 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NESP48681 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NESP48681 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NESP48681 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NESP48681 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NESP48681 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NESP48681 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NESP48681 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms