Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms