Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP214P35658 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP214P35658 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP214P35658 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms