Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms