Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TSPOP30536 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TSPOP30536 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TSPOP30536 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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