Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHC1P29353 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHC1P29353 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHC1P29353 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHC1P29353 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHC1P29353 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHC1P29353 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHC1P29353 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms