Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2E2P29084 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms