Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms