Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms