Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms