Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2AP28223 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms