Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms