Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms