Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTAFRP25105 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTAFRP25105 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTAFRP25105 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms