Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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