Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGCP20142 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGCP20142 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGCP20142 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms