Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CXCL2P19875 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms