Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTLA4P16410 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTLA4P16410 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms