Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRF1P14222 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRF1P14222 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRF1P14222 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRF1P14222 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRF1P14222 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRF1P14222 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRF1P14222 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRF1P14222 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRF1P14222 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRF1P14222 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRF1P14222 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms