Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN1P12814 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms