Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIP12755 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIP12755 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIP12755 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms