Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms