Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI2P10070 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI2P10070 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI2P10070 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI2P10070 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI2P10070 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI2P10070 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI2P10070 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI2P10070 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI2P10070 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI2P10070 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI2P10070 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI2P10070 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms