Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RGPD2P0DJD1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RGPD2P0DJD1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms