Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4BP0C0L5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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