Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRCP08575 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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