Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB2P05107 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms