Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSVO60911 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSVO60911 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSVO60911 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSVO60911 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSVO60911 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms