Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APAF1O14727 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms