Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms