Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA8SH3BPF8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GOLGA8SH3BPF8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GOLGA8SH3BPF8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA8SH3BPF8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA8SH3BPF8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA8SH3BPF8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA8SH3BPF8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA8SH3BPF8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms