Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPIPA3F8WFD2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms