Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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LINC00587B1AMM8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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