Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KNCNA6PVL3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms