Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
A4D1N5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
A4D1N5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms