Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC78A2IDD5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms