Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F8A0AVK6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms