Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms