Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms