Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms